Malzeme Adı

Teknik Özellikleri

CLDN16 GEN DİZİ ANALİZ KİTİ

· Teklif dilen kit CLDN16 GEN i dizi analizi için optimize edilmiş özel primer ve prob tasarımıza sahip olmalı. Teklif edilen kit 50 hasta da 5 bölge,50 kontrol de 5 bölge ve tekrarları ile en az 500 test olmalıdır.Teklif veren firma; gen analizi öncesi, DNA izolasyonu, pcr ,jel ve tüm optimizasyonlar için gereken sarfları ücretsiz temin etmeli. Sonuç çıkana kadar tüm tekrarlar, teklif veren firmaya tarafından ücretsiz karşılanacaktır.Teklif veren firmanın projede yaşanabilecek aksaklıkları önlemek adına, bir hizmet laboratuvarı olmalıdır.Çalışma süresince, aşağıdaki ürünler ve bu ürünler ile birlikte çalışacak cihazlar ücretsiz temin edilmelidir;                             a.PRİMER;                                                                 200nmol HPLC kalitede 10.000 baz primer EU kapsamında olmalı                                             b.HOT STARST TAQ POLYMERASE  Kullanılacak ürün, Hot start özellikte olmalı.Her paketi 600 rxn luk taq polymere , 1 x 120 µL Platinum Taq DNA Polymerase, 3 x 1.25 mL 10X PCR Buffer (no magnesium chloride), 1 x 1 mL 50 mM MgCl2 , 1 x 1.3 mL KB Extender kombinasyon a sahip olmalı.  DNTQ yanında dahil olmalı       c.AGAROSE:                                              Kullanılacak agaroz jel elektroforez uygulamalarında nükleik asitlerin boyuta dayalı olarak ayrılması için kullanılan bir polisakkarittir. Agarose, 100 bp'den >30 kb'ye kadar DNA ve RNA fragmanlarını çözmek için idealdir.Agarose'un Özellikleri: • Rutin uygulamalar için DNA ve RNA analizi ve geri kazanımı için ideal • Güçlü jel yapısı, daha iyi kullanım ve daha az kırılma sağlar • Ouchterlony (antijen-antikor etkileşim testi) ve radyal immünodifüzyon (RID) (antijen niceleme testi) gibi protein elektroforez uygulamalarında kullanılabilir. d.Dye Terminator (sonlandırma) kiti            nKullanılacak Kit; de novo sekanslama, resequencing, PCR ürünü sekanslama, plazmit, fosmit ve BAC templateleri için dizileme çalışmalarına uygun olmalıdır.Kit, Sanger sekanslama için gerekli bileşikleri “pre-mix” halde sunmalıdır.Kit reaktifleri, tek zincirli veya çift zincirli DNA kalıpları ile, PCR fragmanları ile ve uzun zincir kalıpları ile yapılacak floresans bazlı döngü sekanslama reaksiyonlarını gerçekleştirmek için uygun olmalıdır.Baz dizilemede kullanılması amacıyla temin edilecek floresan işaretleyici mix bileşiminde dATP, dGTP, dCTP, dTTP olmak üzere dört çeşit normal nükleotid bulundurmaktadır. Floresan işaretleyici mix bileşiminde diziyi rasgele sonlandırmak için farklı renkte floresan kimyasallarla işaretlenmiş ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP olarak isimlendirilen dideoxynükleotid bulundurmaktadır. Baz dizilemede kullanılması amacıyla temin edilecek floresan işaretleyici mix bileşiminde dATP, dGTP, dCTP, dTTP olmak üzere dört çeşit normal nükleotid bulundurmaktadır.Floresan işaretleyici mix bileşiminde diziyi rasgele sonlandırmak için farklı renkte floresan kimyasallarla işaretlenmiş ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP olarak isimlendirilen dideoxynükleotid bulundurmaktadır. Kit, sekanslama buffer’ını içermelidir.Uzun kalıplar için optimize edilmiş olmalıdır.                                                        e. Polimer                                                           Sanger çalışmalarında kullanılan kapiler elektroforez cihazlarındaki kapiler array’leri kaplayarak çalışma için gerekli elektro-osmotik akışı sağlamalıdır.Sekanslama ve frangman analizi çalışmalarında kullanılmaya uygun olmalıdır.Kısa ve uzun dizilerin sekanslanabilmesi için optimize edilmiş olmalıdır.Kullanım kolaylığı açısından tek bir kese ile paketlenmelidir.Ambalajda ne kadar polimer kullanılıp kullanılmadığının takip edilebilmesi için radyo frekans kimlik etiketi (RFID) bulundurmalıdır.2°-8° derecede saklanmalıdır.          f. Exonuclease                                                      Teklif edilen ürün standart konsantrasyon 20 ünite/ul olmalıdır. Teklif edilen ürünün boyutu 4000 unit olmalıdır.Teklif edilen ürünün enzimi eksonükleaz olmalıdır ve bu enzim tek sarmallı DNA’yı 3’ -> 5’ yönünde parçalamalıdır.Teklif veren firma ürünün Türkiye distribütörü olmalı ya da Türkiye distribütörü tarafından yetki belgesine sahip olmalıdır.Teklif edilen ürünü, belirli oranda Shrimp alkaline phosphatase (sap) ürünü ile kullanılarak PCR temizleme işleminde kullanılmaya uygun olmalıdır.Ürünün moleküler ağırlığı 55 kDa olmalıdır.Ürünün ısı inaktivasyonu 15 dakika boyunca 80 ° C olmalıdır.                                          g. Shrimp Alkaline Phosphatase (SAP)               Teklif edilen ürünün enzimi Alkalin fosfataz olmalıdır.Teklif edilen ürünün boyutu 5000 unit olmalıdır.Teklif edilen Ürünün ağırlığı Homodimer. Monomer, amino asit dizisi ile belirlendiği üzere 55 kDa'dır.Teklif veren firma ürünün Türkiye distribütörü olmalı ya da Türkiye distribütörü tarafından yetki belgesine sahip olmalıdır.Teklif edilen ürünü, belirli Exonuclease-I ürünü ile kullanılarak PCR temizleme işleminde kullanılmaya uygun olmalıdır.