İstenilen cihazın, kırtasiyenin vd. adı

Teknik Özellikleri

1. Kit  doku örnekleri içinde bulunan RNA’nın stabilizasyonunu ve güvenli bir şekilde taşınmasını sağlamalıdır
2. Kit ile, oda sıcaklığında 7 gün, 2-8°C’de 4 hafta RNA saklanabilmeli; -20 veya -80°C’de RNA örnekleri arşivlenebilmelidir.
3. Reaktif 50 ml veya 250 ml’lik şişelerde ambalaj edilmiş olmalıdır.
4. 100 örneklik olmalıdır.
5. Stabilize edilmiş RNA örnekleri bir sonraki aplikasyonda özel bir işleme gerek kalmadan kolayca kullanılabilmelidir.
6. Stabilize edilecek doku materyali 0.5 cm kalınlığında olmalıdır.
7. Teklif veren firmalar üretici firmanın tek yetkili temsilcisi olmalıdır veya Türkiye’ de tek yetkili distribütörü tarafından yetkilendirilmiş olmalıdır.
8. Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır.

RNA Izolasyon kiti ( RNeasy mini kit )

1.  Kit ile hücre, doku ve mayalardan total RNA izolasyonu yapılabilmelidir.

2.                Kit ile elde edilen RNA’lar 200  bp’den büyük olmalıdır.

3.                100 örneklik olmalıdır.

4.                Kit silika membran bazlı spin kolon prosedürü ile çalışmalıdır.

5.                Kit fenol ve kloroform gibi toksik ve kanserojen maddeleri içermemelidir.

6.                Başlangıç materyali olarak en fazla 1x10⁷ hücre, 3   mg doku, 5xl⁷ maya kullanılabilmelidir.

7.                Doku homojenizasyonu için boncuklarla çalışan homojenizatör kurulacaktır. Homojenizatörde kullanılmak üzere 200 adet metal boncuk da cihazlarla birlikte verilmelidir.

8.                Kit prosedürü örneğin lize edilmesi, RNA'nın kolona bağlanması, yıkama ve elusyon basamaklarından oluşmalıdır.

9.                Kit ile elde edilen ürün miktarı 1x10⁷ hücreden 1-35ug, 1   mg dokudan 1-6   ug, 1x10⁷ maya hücresinden 25 mg olmalıdır.

10.    Kit içerisinde test miktar kadar spin kolonlar ve protokolün gerektirdiği sayıda 2 ml' lik toplama tüpleri bulunmalıdır.Kit ile elde edilen uriinler RT-PCR, Q-RT-PCR, cDNA sentezi, northern, dot, slot blot, Poly A RNA Secimi ve mikroarray çalışmalarında kullanılabilmelidir.

11.    Teklif veren firmalar üretici firmanın tek yetkili temsilcisi olmalıdır veya Turkiye' de tek yetkili distribütorü tarafından yetkilendirilmiş olmalıdır

12.    .Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır.

13.    Projede kullanılacak pipet uçları, PCR tüpleri, ependorf tüpler de sağlanmalıdır.

14.    Projede izolasyon aşamalarında gerekli olabilecek ek kimyasallar ve sarflar  sağlanmalıdır.

15.    100 örneklik DNAse kitin yanında sağlanmalıdır.

RT² HT FIRST STRAND KIT

1. cDNA kiti ekstra sarfa ihtiyaç duyulmaksızın DNA kontaminasyonunu elimine etmelidir.
2. Proje için toplam 96 örneklik sağlanmalıdır.

3. Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır.
4.  Teklif veren firmalar üretici firmanın tek yetkili temsilcisi olmalıdır veya Türkiye’ de tek yetkili distribütörü tarafından yetkilendirilmiş olmalıdır.
5. Teklif verecek firma tüm kalemlere fiyat vermelidir.
6. Projede kullanılacak pipet uçları, PCR tüpleri, ependorf tüpler  ve ek kimyasallar sağlanmalıdır.

CUSTOM RT² PROFILER PCR ARRAY

1. Teklif verecek firma tüm kalemlere fiyat vermelidir.
2. Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır.
3. 8 adet gen için  toplam 96 örnekten ekspresyon seviyeleri incelenecektir. Pakette verilen ekspresyon ürünleri ile ekspresyon seviyeleri kantitatif olarak belirlenebilmelidir.
4. Çalışmada gerekli olacak ekspresyon sarflarının verilmelidir.

5. Önerilen paket isteğe bağlı olarak ABI, Bio-Rad, Eppendorf, QIAGEN, Roche, Stratagene ve TaKaRa marka PCR cihazlarına uygun olacak formatta üretilebilmelidir. Teklif veren firma bu formatların tümü için valide kitler sunabilmelidir.
6. 14 adet , 8 gen ekspresyonu için  “Custom Array” formatında toplam 12 plate verilecektir.  
7. “Custom Array” formatında verilecek 12 plate ile toplam 96 örnek çalışılabilecektir.
8. Gen ekspresyonu SYBR Green temelli real time PCR protokolü ile çalışmalıdır.
9. Kullanılan sarflar universal tailing özelliğine sahip olmalı ve böylece miRNA ve mRNA ayrımına gerek kalmamalıdır.
10. Tüm assayler wet-bench valide olmalıdır ve böylece primer performansı garantilenmelidir.
11. Ekspresyon panellerinde kullanıcıya hazır plate formatında içerisinde liyofilize primerler bulunan 100-well rotor-discler sağlanmalıdır.
12. Teklif veren firma örneklerin toplanmasından data analizine kadar komple sistemi önerebilmelidir.
13. Teklif verilen paketteki malzemelerin hepsi aynı marka olmalı, bu şekilde gen ekspresyon sonuçları için üretici firma  %100 garantili vermelidir. Pakette yer alan ürünlerin üreticisi tarafından geliştirilen bir data analiz  yazılımı sayesinde sonuçlar on-line olarak değerlendirilebilmelidir.
14. Data analiz yazılımı ücretsiz ve herkezin ulaşabildiği bir internet sayfası üzerinden kullanılabilmeli, analizi ∆∆C_T yöntemi ile gerçekleştirmelidir.
15. Ekspresyon paketi ile birlikte kuruma ücretsiz DNA/RNA ölçer spektrofotometre ve 100-well rotor-disclere uygun real-time pcr kurulacaktır.
16. Proje kapsamında verilecek 100-well rotor-disc seal kaynaklı buharlaşma problemlerinde firma, sarf edilen rotor-discleri telafi etmelidir.
17. Projede kullanılacak pipet uçları, PCR tüpleri, ependorf tüpler  ve ek kimyasallar sağlanmalıdır.
18. Kurulacak cihaz ile birlikte sonuçlar çalışma başlandığı andan itibaren eş zamanlı olarak görüntülenebilmelidir.
19. Kuruma verilecek cihazın, çalışma verimliliğini arttırması açısından kuru hava ile ısıtıp soğutma yapması gerekmektedir.

20.Teklif veren firma çalışma boyunca istenildiğinde kullanıcıya aplikasyon desteği verebilmelidir.Teklif veren firmalar üretici firmanın tek yetkili distribütörü olmalı ya da tek yetkili distribütörü tarafından yetkilendirilmiş olmalıdır.

RT2 PROFILLER PCR ARRAY

1.       Teklif verecek firma tüm kalemlere fiyat vermelidir.

2.       Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır.

3.                  Önerilen paket ile 12 adet insan dokusundan  Epigenetic Chromatin Remodeling Factors  ekspresyon paneli çalışılacaktır.Pakette verilen ekspresyon ürünleri ile ekspresyon seviyeleri kantitatif olarak belirlenebilmelidir.

4.                  Çalışmada gerekli olacak ekspresyon sarfları verilmelidir.

5.                  Önerilen paket isteğe bağlı olarak ABI, Bio-Rad, Eppendorf, QIAGEN, Roche, Stratagene ve TaKaRa marka PCR cihazlarına uygun olacak formatta üretilebilmelidir. Teklif veren firma bu formatların tümü için valide kitler sunabilmelidir.

6.                  Gen ekspresyonu SYBR Green temelli real time PCR protokolü ile çalışmalıdır.

7.                  Tüm assayler wet-bench valide olmalıdır ve böylece primer performansı garantilenmelidir.

8.                  Ekspresyon panellerinde kullanıcıya hazır plate formatında içerisinde liyofilize primerler bulunan 100-well rotor-discler sağlanmalıdır.

9.                  Teklif veren firma örneklerin toplanmasından data analizine kadar komple sistemi önerebilmelidir.

10.              Teklif verilen paketteki malzemelerin hepsi aynı marka olmalı, bu şekilde gen ekspresyon sonuçları için üretici firma  %100 garantili vermelidir. Pakette yer alan ürünlerin üreticisi tarafından geliştirilen bir data analiz  yazılımı sayesinde sonuçlar on-line olarak değerlendirilebilmelidir.

11.              Data analiz yazılımı ücretsiz ve herkezin ulaşabildiği bir internet sayfası üzerinden kullanılabilmeli, analizi ∆∆C_T yöntemi ile gerçekleştirmelidir.

12.              Ekspresyon paketi ile birlikte kuruma ücretsiz DNA/RNA ölçer spektrofotometre ve 100-well rotor-disclere uygun real-time pcr cihazı kurulacaktır.

13.              Proje kapsamında verilecek 100-well rotor-disc seal kaynaklı buharlaşma problemlerinde firma, sarf edilen rotor-discleri telafi etmelidir.

14.              Projede kullanılacak pipet uçları, PCR tüpleri, ependorf tüpler de sağlanmalıdır.

15.              Projede i real-time PCR aşamalarında gerekli olabilecek ek kimyasallar da sağlanmalıdır.

16.              Kurulacak cihaz ile birlikte sonuçlar çalışma başlandığı andan itibaren eş zamanlı olarak görüntülenebilmelidir.

17.              Kuruma verilecek cihazın, çalışma verimliliğini arttırması açısından kuru hava ile ısıtıp soğutma yapması gerekmektedir.

18.              Teklif veren firma çalışma boyunca istenildiğinde kullanıcıya aplikasyon desteği verebilmelidir.

19.              Teklif veren firmalar üretici firmanın tek yetkili distribütörü olmalı ya da tek yetkili distribütörü tarafından yetkilendirilmiş olmalıdır.

1.       Teklif verecek firma tüm kalemlere fiyat vermelidir.

2.       Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır.

3.       Çalışmada gerekli olacak ekspresyon sarflarının yanında toplamda 100 orneklık  yaklasık 2600 reaksiyonluk SYBR Green mastermix verilmelidir.

4.       Önerilen mastremix isteğe bağlı olarak ABI, Bio-Rad, Eppendorf, QIAGEN, Roche, Stratagene ve TaKaRa marka PCR cihazlarına uygun olacak formatta üretilebilmelidir.

5.       Teklif veren firma bu formatların tümü için valide kitler sunabilmelidir.Kullanılan sarflar universal tailing özelliğine sahip olmalı ve böylece miRNA ve mRNA ayrımına gerek kalmamalıdır.

6.       Sybr Green prensibine uygun master mix yeterli miktarlarda paket olarak aynı markadan teklif edilmelidir

7.       .Tüm assayler wet-bench valide olmalıdır ve böylece primer performansı garantilenmelidir.