Kaşe/ İmza

TEKNİK ŞARTNAME

miRNA İzolasyon kiti ( miRNeasy FFPE kit )

1.      Kit 100 örneklik olmalıdır.

2.      100 örneklik DNAse kitin yanında sağlanmalıdır.

3.      Kit parafin bloğa gömülü dokulardan  miRNA izolasyonu yapılabilmelidir.

4.      Kit ile elde edilen miRNA’lar 200 bp’den büyük olmalıdır.

5.      Kit silika membran bazlı spin kolon prosedürü ile çalışmalıdır.

6.      Kit fenol ve kloroform gibi toksik ve kanserojen maddeleri içermemelidir.

7.      Başlangıç materyali olarak en fazla 3 mg doku kullanılabilmelidir.

8.      Kit prosedürü örneğin parafin bloktan uzaklaştırılması, lize edilmesi, miRNA'nın kolona bağlanması, yıkama ve elusyon basamaklarından oluşmalıdır.

9.      Kit ile elde edilen ürün miktarı 1x107 hücreden 1-35ug, 1   mg dokudan 1-6   ug, 1x107 maya hücresinden 25 mg olmalıdır.

10.   Kit içerisinde test miktar kadar spin kolonlar ve protokolün gerektirdiği sayıda 2 ml' lik toplama tüpleri bulunmalıdır. Kit ile elde edilen ürünler RT-PCR, Q-RT-PCR, cDNA sentezi, northern, dot, slot blot, ve mikroarray çalışmalarında kullanılabilmelidir.

miScript II RT Kit

1.       miScript II RT kiti ekstra sarfa ihtiyaç duyulmaksızın DNA kontaminasyonunu elimine etmelidir.

2.       Proje için toplam 12 ve 50 lik paketlerde 62  örneklik sağlanmalıdır.

miScript miRNA PreAMP PCR Kit

1. Kit Pre amplifikasyonu sağlayacak tüm kimyasalları içermelidir.
2. 60 örneklik olmalıdır.

RT² QPCR Primer Assay

1. 10 adet miRNA geni ve 1 adet housekeeping gen için  toplam 54 örnekten ekspresyon seviyeleri incelenecektir. Pakette verilen ekspresyon ürünleri ile ekspresyon seviyeleri kantitatif olarak belirlenebilmelidir.
2. Önerilen paket isteğe bağlı olarak ABI, Bio-Rad, Eppendorf, QIAGEN, Roche, Stratagene ve TaKaRa marka PCR cihazlarına uygun olacak formatta üretilebilmelidir. Teklif veren firma bu formatların tümü için valide kitler sunabilmelidir.
3. Gen ekspresyonu SYBR Green temelli Real Time  PCR protokolü ile çalışmalıdır.
4. Tüm assayler wet-bench valide olmalıdır ve böylece primer performansı garantilenmelidir.
5. Ekspresyon panellerinde kullanıcıya hazır liyofilize primerler sağlanmalıdır.
6. Data analiz  ∆∆CT yöntemi ile gerçekleştirmelidir.
7. Kurulacak Real Time PCR cihazı  ile birlikte sonuçlar çalışma başlandığı andan itibaren eş zamanlı olarak görüntülenebilmelidir.
8. Kurulacak Real-Time PCR  cihazının, çalışma verimliliğini arttırması açısından kuru hava ile ısıtıp soğutma yapması gerekmektedir.

RT ^2vProfıller PCR Array

1.                  Önerilen paket ile 6 adet insan dokusundan Human miFinder miRNA PCR Array  ekspresyon paneli çalışılacaktır. Pakette verilen ekspresyon ürünleri ile ekspresyon seviyeleri kantitatif olarak belirlenebilmelidir.

2.                  Önerilen paket isteğe bağlı olarak ABI, Bio-Rad, Eppendorf, QIAGEN, Roche, Stratagene ve TaKaRa marka PCR cihazlarına uygun olacak formatta üretilebilmelidir. Teklif veren firma bu formatların tümü için valide kitler sunabilmelidir.

3.                   Gen ekspresyonu SYBR Green temelli real time PCR protokolü ile çalışmalıdır.

4.                   Tüm assayler wet-bench valide olmalıdır ve böylece primer performansı garantilenmelidir.

5.                   Ekspresyon panellerinde kullanıcıya hazır plate formatında içerisinde liyofilize primerler bulunan 100-well rotor-discler sağlanmalıdır.

6.                  Kurulacak Real-Time cihaz ile birlikte sonuçlar çalışma başlandığı andan itibaren eş zamanlı olarak görüntülenebilmelidir.

7.                  Kuruma verilecek Real-Time PCR cihazının , çalışma verimliliğini arttırması açısından kuru hava ile ısıtıp soğutma yapması gerekmektedir.

RT² SYBR GREEN  MASTERMIX

1.       Çalışmada gerekli olacak ekspresyon sarflarının yanında toplamda 60 örneklik  yaklaşık 1900 reaksiyonluk SYBR Green mastermix verilmelidir.

2.       Önerilen mastremix isteğe bağlı olarak ABI, Bio-Rad, Eppendorf, QIAGEN, Roche, Stratagene ve TaKaRa marka PCR cihazlarına uygun olacak formatta üretilebilmelidir.

3.       Teklif veren firma bu formatların tümü için valide kitler sunabilmelidir.

4.       Sybr Green prensibine uygun master mix yeterli miktarlarda paket olarak aynı markadan teklif edilmelidir

5.       Tüm assayler wet-bench valide olmalıdır ve böylece primer performansı garantilenmelidir.

1. Teklif veren firma örneklerin toplanmasından data analizine kadar komple sistemi önerebilmelidir.

2. Çalışmanın bütünlüğü açısından tüm kalemler aynı marka olmalıdır ve teklif verecek firma tüm kalemlere fiyat vermelidir.

 3.Projenin her aşamasında kullanılacak pipet uçları, PCR tüpleri, ependorf tüpler vb. sarflar sağlanmalıdır.

4.Teklif veren firma doku homojenizasyonu için boncuklarla çalışan homojenizatör kuracaktır. Homojenizatörde kullanılmak üzere 200 adet metal boncuk da cihazlarla birlikte verilmelidir.

5.Teklif veren firmalar üretici firmanın tek yetkili temsilcisi olmalıdır veya Turkiye' de tek yetkili distribütorü tarafından yetkilendirilmiş olmalıdır

6.Projenin tüm aşamalarında kitlerin sağlamadığı  gerekli olabilecek ek kimyasallar ve sarflar  sağlanmalıdır.

7.Ekspresyon paketi ile birlikte kuruma ücretsiz DNA/RNA ölçer spektrofotometre ve 100-well rotor-disclere uygun Real-Time PCR kurulacaktır.

8.Teklif veren firma çalışma boyunca istenildiğinde kullanıcıya aplikasyon desteği verebilmelidir.

9.Sonuçlar  için üretici firma  %100 garantili vermelidir.

10.Proje kapsamında verilecek 100-well rotor-disc seal kaynaklı buharlaşma problemlerinde ve Real-Time PCR cihazındaki teknik arızlardan kaynaklı problemlerde  firma, sarf edilen rotor-discleri telafi etmelidir.